Les bactéries sont des cellules procaryotes qui contiennent des séquences d'ARNr uniques différentes d'Archaea et d'Eucarya. Ils sont encapsulés dans des membranes cellulaires composées de chaînes de peptidoglycane et d'acides gras non ramifiés attachées aux molécules de glycérol par des liaisons ester.
Les différents exemples de bactéries de domaine sont les suivants
- Aquifères
- Thermotogues
- Thermodésulfobactéries
- Déinocoque
- Chrysiogénètes
- Chloroflexi
- Nitrospira
- Les déferribactéries
- Cyanobactéries
- Chlorobie
- Protéobactéries
- Firmicutes
- Actinobactéries
- Planctomycètes
- Chlamydiae
- Spirochètes
- Acidobactéries
- Bacteroidetes
- Fusobactéries
- Fibrobactérie
Aquifères
Le phylum Aquifères est considérée comme la plus ancienne branche de bactéries.
Aquifex pyrophile est un Gram-négatif en forme de bâtonnet, bactérie microaérophile. Ce thermophile bactérie peut prospérer à des températures allant de 85 ° C et 95 ° C. Aquifère est un lithoautotrophe qui utilise de l'hydrogène, du thiosulfate et du soufre avec de l'oxygène comme accepteurs d'électrons terminaux.
Thermotogues
La deuxième branche la plus ancienne est le phylum Thermotogues. Ce phylum comprend Gram-négatif, thermophiles en forme de bâtonnet enfermé dans une enveloppe qui se prolonge des deux extrémités comme un ballon. Ils s'épanouissent activement dans régions géothermiques.
À l'opposé, Thermotogues est une chimiohétérotrophe qui peuvent survivre en anaérobiose grâce aux glucides et aux protéines.
Thermodésulfobactéries
Ceux-ci sont bactéries réductrices de soufre qui utilise le sulfate comme accepteur d'électrons pour la respiration anaérobie. Ces bactéries peuvent respirer du sulfate. Exemple Thermodésulfobactérie hydrogéniphilum est une bactérie sulfato-réductrice thermophile.
Déinocoque
Ce groupe de bactéries est très résistant à rayons gamma ainsi que Rayonnement UVn.m. Ils ont cellule épaisse walls et peut habiter espace extra-atmosphérique pendant des années. Ils ont un pigment caroténoïde caractéristique déinoxanthine ce qui donne à la bactérie sa couleur rose.
Déinocoque radiodurans est un membre important de ce phylum. C'est un poly-extrêmophile, bactérie non endosporogène qui tire son énergie de composés organiques.
Chrysiogénètes
Chrysiogène arsenatis est un membre de cette classe qui utilise l'arséniate comme accepteur d'électrons terminal. Ces bactéries anaérobies se trouvent généralement dans sols contaminés par l'arsenic. Ils apparaissent comme des cellules mobiles en forme de bâtonnet avec un seul flagelle. Ils réduisent arséniate en arsénite. Il peut utiliser l'acétate, le pyruvate, le lactate, le malate et le fumarate comme source de carbone.
Chloroflexi
Ce phylum est maintenant appelé Chloroflexote qui comprend thermophile aérobie bactéries, et phototrophes anoxygéniques. Ils ont une seule membrane mais apparaissent comme gram-négatifs après coloration. Ce sont des bactéries photosynthétiques anoxygéniques vertes sans soufre, qui contiennent BChl a et c / d et des caroténoïdes tels que le carotène, le β-carotène et la myxocoxanthine comme principaux pigments photosynthétiques.
Nitrospira
C'est une bactérie gram-négative capable de oxydation des nitrites. Il est hélicoïdal en morphologie et reste en agrégats. Cette chimiolithoautotrophe bactérie est utilisée dans les stations d'épuration et réduit les émissions de gaz à effet de serre. Tel quel contient Gènes de la nitrite oxydoréductase il est donc mentionné comme un oxydant de nitrite.
Les déferribactéries
Ce groupe contient des bactéries anaérobies gram-négatives. Ils sont en forme de tige et utilisent du fer, du manganèse et du nitrate pour la respiration. Géovibrio est un membre non sporulant de cette classe qui utilise le sulfure, le formiate et l'acétate comme donneurs d'électrons tandis que le soufre, le nitrate et le fumarate comme accepteurs d'électrons.
Cyanobactéries
Ce groupe est le groupe de bactéries le plus diversifié qui contient environ 2000 espèces et plus. Ces bactéries gram-négatives sont également connues sous le nom de algues bleu-vert.
Les cyanobactéries utilisent la chlorophylle a et les photosystèmes I et II. La réserve de carbone est le glycogène et contient phycocyanine ainsi que phycoérythrine comme pigments nécessaires aux réactions lumineuses. Ces pigments sont stockés dans des organites spécialisés appelés phycobilisomes qui sont similaire aux chloroplastes de plantes.
Certaines cyanobactéries importantes sont les suivantes
Nostoch
Ce sont des cyanobactéries filamenteuses réparties dans les écosystèmes terrestres et aquatiques. Il est souvent impliqué dans l'interaction symbiotique avec les plantes et aide à fixateur d'azoten.m. Ces bactéries ont hétérocyste, une cellule spécialisée responsable de l'assimilation de l'azote. Nostoch est largement utilisé comme biofertilisant.
anabaena
anabaena est un autre genre important du groupe des cyanobactéries qui aide à fixation de l'azote. Ils contiennent des hétérocystes qui convertissent l'azote en ammoniac organique et sont souvent utilisés comme biofertilisant in rizières.
spiruline
Ce genre est un groupe de cyanobactéries de renommée mondiale, appelé superaliment. Il ne contient pas d'hétérocyste. Cependant, spiruline est très populaire comme complément alimentaire car il stocke une grande quantité de protéines (65-70%). Il est riche en chlorophylle et en caroténoïdes qui agissent comme antioxydants et contiennent des vitamines telles que l'acide folique, la vitamine B2 et la vitamine B12 ainsi que d'autres minéraux nécessaires.
Chlorobie
Les membres représentatifs de ce groupe sont Tépidu de chlorobiumm ainsi que Vibrioforme de chlorobiume. Ce sont des photoautotrophes anaérobies, bactéries soufrées vertes qui utilise des composés soufrés réduits pour les électrons et effectue une photosynthèse non cyclique. Ils contiennent BChl c, BChl d, et BChl e.
Protéobactéries
Les protéobactéries sont également connues sous le nom de Pseudomonadota. Ce phylum comprend des bactéries gram-négatives qui effectuent photosynthèse anoxygénique.
- Alpha protéobactéries
- Bêta protéobactéries
- Protéobactéries gamma
- Protéobactéries delta
- Protéobactéries Epsilon
- Protéobactéries zêta
Alpha protéobactéries
Les principaux pigments photosynthétiques sont le BChl a/b et les caroténoïdes tels que le lycopène et la rhodopsine. Ils utilisent des composés d'hydrogène et de soufre réduits comme donneurs d'électrons et utilisent le photosystème II pour la photosynthèse.
| Méthylobactérie | Peut utiliser des composés C1, normalement présents dans le sol et l'eau, aérobie facultatif |
| Rhizobium | Bactéries du sol fixatrices d'azote associées à la plante Leguminosae, cellules mobiles |
| Caulobactérie | Hétérotrophes et oligotrophes avec des cellules en forme de bâtonnet ou de vibrion |
| Agrobacterium | L'agent pathogène des plantes provoque des tumeurs, des chimioorganotrophes, des bâtonnets mobiles aérobies non sporulés |
| Rickettsies | Parasites intracellulaires obligatoires, pléomorphes |
| Brucella | Pathogène, coccobacille à flagelles |
| Coxielle | Les parasites obligatoires provoquent la fièvre Q |
| Rhodospirille | Photohétérotrophes aérobies ou anaérobies |
Bêta protéobactéries
Ces bactéries violettes non soufrées contiennent des bactériochlorophylles et des caroténoïdes comme principaux pigments photosynthétiques. Ils peuvent survivre dans un large éventail d'environnements en utilisant diverses stratégies métaboliques. Ils utilisent des formes réduites d'azote et de soufre comme donneurs d'électrons.
| Bordetella | Aérobies, non mobiles, coccobacilles parasites des mammifères, ont besoin de soufre organique et d'azote |
| Neisseria | Pathogène provoque la gonorrhée et la méningite, oxydases positives, résident des membranes muqueuses des mammifères |
| burkholderia | Des bâtonnets aérobies droits avec un seul flagelle, avec du poly-β-hydroxybutyrate comme matériau de réserve, provoquent la fibrose kystique |
| Leptothrix | Barres droites aérobies recouvertes d'une gaine contenant des oxydes de fer et de manganèse, présentes dans les canalisations bouchées |
| Nitrosomonas | Ammoniac-oxydant, chimiolithoautotrophe obligatoire |
| Thiobacillus | Les autotrophes produisent du sulfate en oxydant H2S, bénéfique pour les plantes |
Protéobactéries gamma
| Azotobacter | Bactérie aérobie, forme des kystes et aide à la fixation de l'azote |
| Escherichia | Facultativement de nature anaérobie, oxydase négative, convertit l'acide formique en H2 et CO2, parasites communs des mammifères |
| Méthylocoque | Bactérie aérobie utilisant le méthane, forme généralement des kystes |
| hémophile | Bactérie facultative ou aérobie, oxydase positive, fermentative, fréquemment présente comme parasite des mammifères |
| Pseudomonas | Chimiohétérotrophes à respiration aérobie, agents pathogènes courants pour les animaux et les plantes |
Protéobactéries delta
| Bdellovibrio | Il s'agit d'une bactérie pathogène aérobie qui se développe dans l'espace périplasmique d'autres bactéries gram-négatives. |
| Desulfovibrio | Bactérie réductrice de soufre qui habite les lacs pollués et les lagunes d'eaux usées |
| Désulfuromonas | Bactérie réductrice de soufre principalement présente dans les environnements d'eau douce anoxiques |
| Myxocoque | Bactérie aérobie et mobile généralement présente dans le sol et restant sous forme de myxospores dormantes. Ce sont des micro prédateurs et divers secrets enzymes digestives pour lyser d'autres cellules bactériennes. |
Protéobactéries Epsilon
Ce sont des protéobactéries microaérophiles à Gram négatif en forme de bâtonnet.
| Campylobacter | Ce genre comprend à la fois des membres pathogènes et non pathogènes. Ce sont des bactéries fermentatives positives à l'oxydase que l'on trouve souvent dans le tractus intestinal et la cavité buccale des animaux. |
| Helicobacter | Ceux-ci sont à la fois catalase et oxydase positifs, généralement présents dans le tractus gastro-intestinal des humains. |
Protéobactéries zêta
Ce groupe est représenté par Mariprofundus ferrooxydans. Cette bactérie se trouve en haute mer spécialement au niveau des cheminées hydrothermales en tant que micro-organisme oxydant le fer.
Firmicutes
Ce phylum contient des bactéries gram-positives. Basé sur l'analyse de l'ARNr 16S, ce phylum contient des bactéries avec faible teneur en G+C.
| classe: Mollicutes | |
| Acholéplasme | Principalement présent chez les vertébrés, avec une température optimale de 30 à 37 °C |
| Anaéroplasme | Habiter le rumen des bovins et des anaérobies |
| Entomoplasme | Habituellement présent chez les insectes et les plantes avec une croissance optimale à 30°C |
| Mycoplasma | Présent chez l'homme et l'animal avec une température optimale de 37°C, nécessite du stérol pour sa croissance |
| Spiroplasme | Les filaments hélicoïdaux poussent à 30-37°C chez les insectes et les plantes |
| Ureaplasma | Capable d'hydrolyse de l'urée, présente chez l'homme et l'animal |
| classe: Clostridia | |
| Clostridium | Anaérobies, chimioorganotrophes à endospores ovales ou sphériques, pléomorphes en forme de bâtonnets, catalase négative |
| Héliobactérie | Anaérobies, photohétérotrophes avec BChl g |
| classe: Bacille | |
| Bacille | Chimioorganotrophes aérobies ou facultatifs en forme de bâtonnet droit, à endospores, catalase positive |
| Entérocoque | Cellules sphériques ou ovoïdes facultatives, catalase-négatives et soumises à fermentation, produisent du lactate avec n'importe quel gaz, présent dans les matières fécales |
| Lactobacillus | Facultatif ou microaérophile, non sporulant, fermentatif, catalase négatif |
| Staphylococcus | Chimioorganotrophes, catalase positive, pathogènes, présents dans la peau et les muqueuses de l'homme |
| Streptocoque | Fermentaire, produit du lactate sans aucun gaz, catalase négative, hémolyse positive, parasites des animaux |
Actinobactéries
C'est un fascinant groupe de bactéries produisant des caractéristiques métabolites secondaires avec anticancéreuxet anti-helminthique Propriétés. Leur cycle de vie implique le développement d'hyphes filamenteux porteurs de spores.
| Arthrobactérie | Aérobie, présent sous forme de cellules en forme de bâtonnets (jeunes) ou de petits coques (vieux), catalase positive, principalement présent dans le sol |
| Corynebacterium | Facultativement anaérobies, fermentaires, oxydase positive |
| Micrococcus | Aérobie, présent sous forme de tétrades ou de cocci irréguliers, catalase positive, résident sur la peau des mammifères et également présent dans le sol |
| Mycobactérie | Bâtonnets aérobies, légèrement incurvés, catalase positive, présents dans le sol et l'eau, parfois de nature pathogène |
| Streptomyces | Mycélium végétatif ramifié aérobie avec mycélium aérien contenant des spores, peut utiliser divers composés organiques |
| Frankia | Mycélium végétatif ramifié aérobie ou microaérophile sans mycélium aérien, généralement présent en tant que symbiote avec les plantes |
Planctomycètes
Ce groupe de bactéries est largement distribué dans les environnements aquatiques et terrestres. Ils jouent un rôle important dans les cycles du carbone et de l'azote et peuvent survivre avec des sources limitées de carbone et d'azote. Ils n'ont pas la couche de peptidoglycane et ont des compartiments internes séparés.
Ces anaérobies sont capables d'oxyder ammoniac en azote au sein d'une entreprise spécialisée organite appelé anammoxosome qui présente des similitudes avec les mitochondries eucaryotes.
Chlamydiae
Ce groupe comprend les parasites intracellulaires obligatoires ; certains sont pathogènes tandis que d'autres restent des symbiotes d'humains et d'animaux. Il manque également une couche de peptidoglycane. Exemple Chlamydia pneumoniae qui cause la pneumonie, et Chlamydia trachomatis qui cause la chlamydia.
Spirochètes
Ceux-ci sont à double membrane bactéries gram-négatives avec formes de tire-bouchon distinctes. Ce groupe a des flagelles distincts connus sous le nom de endoflagelle qui est ancré à la fin de la cellule bactérienne. Il a un mouvement de torsion. La plupart des espèces sont de nature pathogène.
Acidobactéries
Ce phylum représente les bactéries du sol gram-négatives et acidophiles. Principalement présent dans sources d'eau chaude ainsi que sols contaminés par des métaux. Dans le sol, il représente 52% des bactéries totales du sol communauté. Il contient de la bactériochlorophylle a et des caroténoïdes tels que l'échinénone, le lycopène, le ɣ- et le β-carotène. Il utilise des composés organiques tels que l'acétate et le succinate comme donneurs d'électrons
Bacteroidetes
Il peut s'agir de bactéries pathogènes ou symbiotiques. Ce sont des bactéries gram-négatives en forme de bâtonnets. Certaines espèces peuvent dégrader des polysaccharides complexes de plantes comme l'amidon et la cellulose. Ils exposent protéase ainsi que l'uréase activité.
Fusobactéries
Ceux-ci sont obliger les anaérobies avec une morphologie en forme de tige. Les espèces de ce phylum colonisent la membrane muqueuse de l'homme et provoquent des amygdalites et des abcès périamygdaliens.
Fibrobactérie
Ce phylum comprend des bactéries capables de dégrader la cellulose et généralement présent dans le rumen des bovins. Ce phylum est représenté par deux membres Fibrobacter succinogènes ainsi que Fibrobactérie intestinale.
Résumé
Les bactéries du domaine comprennent un groupe diversifié de micro-organismes qui utilisent diverses stratégies métaboliques. Grâce à de tels processus métaboliques, ceux-ci peuvent prospérer n'importe où, des bouches hydrothermales des grands fonds marins à l'espace extra-atmosphérique. Ils peuvent utiliser des sources de carbone organiques et inorganiques. Certains sont pathogènes, commensaux tandis que d'autres sont bénéfiques pour les plantes.
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Je suis doctorant au CSIR-CIMAP, Lucknow. Je me consacre au domaine de la métabolomique végétale et des sciences de l'environnement. J'ai obtenu mon diplôme universitaire à l'Université de Calcutta avec une expertise en biologie moléculaire végétale et en nanotechnologie. Je suis un lecteur ardent et je développe sans cesse des concepts dans toutes les niches des sciences biologiques. J'ai publié des articles de recherche dans des revues à comité de lecture d'Elsevier et Springer. Outre les intérêts académiques, je suis également passionné par les choses créatives telles que la photographie et l'apprentissage de nouvelles langues.
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